En Tánger, 1941, Eric DeHaan, capitán del carguero holandés Noordendam, es reclutado por la inteligencia naval holandesa. DeHaan dirige su barco, disfrazado de carguero español neutral, a través de una serie de misiones secretas para los intereses navales británicos. Estas misiones incluyen llevar comandos británicos en incursiones contra una estación de observación alemana en la Túnez francesa, participar en convoyes de emergencia, transportar bombas desde Alejandría a las fuerzas británicas asediadas en Creta e instalar un puesto de escucha en la costa sur de Suecia, frente a las bases alemanas en el Báltico. Lentamente, el Noordendam se convierte en un barco de fugitivos: un ex teniente de la marina polaca, un polizón griego de Creta, un estudiante de medicina refugiado judío reclutado como médico del barco y Maria Bromen, una periodista marítima rusa, todos huyendo y atrapados en los mares hasta que termine la guerra. Operaciones secretas, romance y batallas en callejones portuarios y en el mar, 'Dark Voyage' nos lleva con suspense a través del mundo de espías de 1941.